2006年9月23日現在
()は「路線上におけるJR境界駅」を示す。
本線系統 画像は大月駅にて撮影した115系スカ色

東海道本線 東京〜(熱海)〜(米原)〜神戸・大垣〜美濃赤坂
中央線 神田〜代々木・新宿〜みどり湖〜(塩尻)〜名古屋・岡谷〜辰野〜塩尻(登記上の表記による)
北陸線 米原〜直江津
高山線 岐阜〜(猪谷)〜富山
関西線 名古屋〜(亀山)〜JR難波
紀勢線 亀山〜(新宮)〜和歌山市
支線系統 画像は大府駅にて撮影したキハ75系

伊東線 熱海〜伊東
小海線 小淵沢〜小諸
篠ノ井線 塩尻〜篠ノ井
大糸線 松本〜(南小谷)〜糸魚川
飯山線 豊野〜飯山〜越後川口
御殿場線 国府津〜御殿場〜沼津
身延線 富士〜身延
飯田線 豊橋〜辰野
武豊線 大府〜武豊
名松線 松阪〜伊勢奥津
参宮線 多気〜鳥羽
小浜線 敦賀〜東舞鶴
舞鶴線 東舞鶴〜綾部
草津線 柘植〜草津
湖西線 山科〜近江塩津
奈良線 京都〜木津
大阪環状線 大阪〜天王寺〜大阪
吉備線 岡山〜総社
伯備線 倉敷〜伯耆大山

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